I et års tid bar han på en hemmelighed, der blev meldt officielt ud i juni i år, men som han blev bekendt med en dag i sommeren 2022, da en mail landede i hans indbakke. Der var vedhæftet et dokument, underskrevet af repræsentanter for rumfartsorganisationerne NASA, ESA samt Japan, Canada og Rusland, som i fællesskab driver rumstationen. Alle sagde god for, at den danske astronaut skulle være commander på den internationale rumstation under en del af sit ophold. En rolle, der blandt andet betyder, at han har kontakten til kontrolcenteret på Jorden – samme kontrolcenter, hvor han selv har arbejdet som led i sit job som astronaut. Som commander er det også Andreas Mogensen, der i en nødsituation, for eksempel brand eller alvorlig sygdom hos en astronaut, skal sørge for, at alle procedurer bliver fulgt, forklarer han fra hjemmet i Houston, da der er hul igennem på online-forbindelsen.
»Det er ikke en lederrolle, hvor jeg skal give kommandoer, for det er folk, der er gode til at samarbejde, men det er klart, at hvis der sker noget uventet, for eksempel en ulykke, så skal der være en klar leder, der kan udstikke ordrer og sørge for, at vi alle arbejder på at løse problemet,« forklarer han.
I yderste konsekvens har han, ifølge rumstationens Code of Conduct, lov til at bruge fysisk magt, hvis en astronauts handlinger udsætter besætningen for fare. Det bliver næppe aktuelt, for det er – sandsynligvis – andre udfordringer, besætningen står over for.